Специалисты полагают, что конечная, непосредственная, причина затопления крана - поступление больших масс воды во внутренние помещения. В связи с этим, судно потеряло равновесие.

Согласно данным расследования, судовладелец не обеспечил безопасности крана и экипажа, а также не выполнил требования нормативных документов, регламентирующих действия на мели. Буксировка крана проводилась с поднятой в рабочее положение стрелой, с затопленными отсеками и повреждениями, не обеспечивающими безопасность экипажу.

В сообщении комиссии говорится, что владелец судна принял решение о буксировке без проведения внеочередного освидетельствования Российским речным регистром. Также не был составлен акт о готовности крана к буксировке, предусмотренный инструкцией. Кран не был предъявлен Российскому речному регистру для определения возможности его разового перегона к месту постоянного ремонта.

Эксперты отметили, что судовладелец начал буксировку плавкрана без учета прогноза погоды на маршрут перехода, сообщает пресс-служба Ространснадзора.

Крушение произошло в двух с половиной милях от берега. Экипаж судна состоял из восьмерых жителей Новороссийска. Пятерых членов экипажа подняли на борт буксира и доставили в бухту Балаклавы. На берегу их передали сотрудникам скорой помощи.

На месте поисковой операции обнаружили спасательный жилет и круг с затонувшего крана. Главное следственное управление СКР по Республике Крым возбудило уголовное дело по ч. 3 ст. 263 УК РФ «Нарушение правил безопасности движения и эксплуатации морского транспорта, повлекшее по неосторожности смерть двух или более лиц». Пятерых спасенных моряков плавучего крана 12 октября доставили в севастопольскую больницу № 9. Их выписали из больницы на следующий день.

Утром 13 октября возобновили прерванные из-за наступления темноты и усиления шторма поиски на море. Спасателям удалось установить точное местонахождение плавучего крана. Туда планировали направить водолазов ЮРПСО со специальным глубоководным оборудованием, но из-за шторма операцию перенесли на 14 октября. В Крыму 15 октября спасатели продолжили поиски троих членов экипажа плавучего крана.

Росморречфлот 15 октября направил исследовательский теплоход «Импульс» к месту затонувшего плавучего крана под Ялтой, 18 октября МЧС прекратило активную фазу поисковой операции троих новороссийских моряков. В МЧС заявили, что работы внутри плавкрана представляют опасность для водолазов, и для того чтобы обследовать затонувшее судно, его необходимо поднять на поверхность.

По делу о крушении плавкрана задержали директора Азово-Черноморского филиала ФБУ «Морспасслужба Росморречфлота», которого подозревают в нарушении техники безопасности при эксплуатации плавсредства. Его поместили под домашний арест. 

По данным следствия, 11 октября 2016 года обвиняемый, не предприняв должных мер по осуществлению надлежащего контроля за устранением технических неисправностей плавкрана, дал устное незаконное указание капитану морского буксира «Меркурий» начать буксировку судна после устранения повреждений в его корпусе, не обеспечив при этом безопасные условия труда членам экипажа плавкрана.