Японский кит внесён в международную Красную книгу как исчезающий вид.

Это эндемик Северной Пацифики – так называется северная часть Великого Тихого океана с его прибрежьем — Дальний Восток России (Камчатка, Сахалин, Приморье, Магаданская область, Корякия, Чукотский автономный округ, Хабаровский край), штат Аляска Соединённых Штатов Америки, тихоокеанское побережье Канады и Японии.

Местонахождение Командорского заповедника — Командорские острова (острова Беринга, Медный, Топорков, Арий Камень) и прилегающая к ним часть морской акватории шириной 30 миль. Это самый большой морской заповедник страны. Защищенная от рыболовного промысла акватория служит местом нагула для 21 вида китообразных.

Биология японского кита исследована крайне плохо, например, до сих пор не известны места его размножения, а пути миграции мало изучены. Считается, что, животные держатся как поодиночке, так и небольшими группами. И нынешнее наблюдение, и регистрация 2012-2013 годов противоречат принятой точке зрения.

На японского кита в своё время велась интенсивная охота. Предполагается, что между 1839 и 1909 годами было убито от 26 500 до 37 000 особей. В 1960-х годах американские китоловы нелегально убили ещё 500 японских китов.

Сегодня главными угрозами для них являются столкновения с кораблями, застревание в рыболовецких сетях и загрязнение окружающей среды. Популяция оценивается в 400 животных в Охотском море и ещё около 100 – в восточной части Тихого океана.

В российском фотокаталоге 2017 года зарегистрировано 17 японских китов (четверо из них – те, кого видели здесь в 2012-2013 годах). Теперь фотоидентификационный номер получили еще трое.